Если имеется анализ на "дисбактериоз"-можете сразу про него забыть
http://forums.rusmedserv.com/showthread.php?t=25687, и если педиатр назначает этот диагноз-можете сразу идти к другому.
Ребенок в 3 мес питается только молоком, какого кала Вы ожидаете?