И с чего вы вообще взяли что Бог творил на уровне молекул, белков и атомов?
Копайте глубже господа.
фотон — квант электромагнитного поля;
глюон — квант векторного (глюонного) поля в квантовой хромодинамике (обеспечивает сильное взаимодействие);
гравитон — гипотетический квант гравитационного поля;
фонон — квант колебательного движения атомов кристалла.
А может и еще глубже.
Ребенок научившись завязывать шнурки, держать ложку, самостоятельно одеваться начинает осозновать себя Независимой личностью. Но мы то знаем, что ему еще учиться и учиться.